Fernando Pacheco Flores se narodil 18. května roku 1992 ve španělském Badajozu. Do slavné madridské cantery přišel v roce 2006, kdy mu bylo čtrnáct let. Ihned se zařadil mezi nejdůležitější články výběrů Juvenilu B a následně Juvenilu A. Jeho talentu si všiml také trenér prvního mužstva Realu Madrid, José Mourinho, který jej několikrát nominoval na utkání. Mezi dospělými ovšem poprvé debutoval ve výběru Realu Madrid C, když zasáhl do utkání s Rayo Majadahonda v Tercera División.
Svůj debut v prvním mužstvu Realu Madrid si Fernando Pacheco připsal 20. prosince roku 2011. Tehdy královský velkoklub vedl v utkání s Ponferradinou v Copa del Rey již 5:1 a José Mourinho mladého Fernanda poslal na hřiště za Antonia Adána. V sezóně 2012/13 alternoval mezi Realem Madrid C a rezervní Castillou, do které se trvale přesunul o sezónu později. Byl tak u toho, když Castilla spadla ze Segunda División, ovšem Fernando Pacheco rozhodně svými výkony nezklamal.